پرورش توت فرنگی گلخانه ای در خاک بدون در نظر گرفتن تناوب، منجر به بروز برخی مشکلات برگرفته از خاک می شود و به همین دلیل ضدعفونی خاک به صورت یک عمل معمول در تولید توت فرنگی حتی در مزارع در آمده است. مزیت مهم کشت بدون خاک توت فرنگی، عدم نیاز به استرلیزه کردن خاک می باشد. ترکیب مناسب بستر در کشت هیدروپونیک، باعث افزایش دوره برداشت، تولید خارج از فصل و افزایش عملکرد می گردد. طبق آزمایشات گوناگون بهترین خصوصیات کمی و کیفی میوه از بستر مخلوط پرلیت – کوکوپیت با نسبت های حجمی ۷۵-۲۵ و ۵۰-۵۰ به دست آمده است. نسبتهای حجمی، دارای ذخیره متوسط آب، تهویه مناسب و شدت شوری پایین بوده است. اندازه یا وزن میوه با مقدار آب موجود در بستر کشت ارتباط مستقیمی دارد. از طرفی پرلیت تهویه بستر کشت را نیز بهبود می بخشد.